的存在。蛇灵人手众多不下万人，之前几次狄仁杰他们已经铲除了几千人，也不过是蛇灵的一半左右。现在并不是铲除蛇灵的最佳时机，这些杀手一击不成，便远遁千里。按照原剧情，最近几个月蛇灵正在准备一个巨大的颠覆计划。只有在这时，蛇灵的所有人口才会集中起来，方便铲除。
同时，狄仁杰也从张不凡的口中得知了如今蛇灵总坛的具体位置，但是蛇灵总坛附近有不少蛇穴的存在，这些蛇穴即是出入口，又是暗哨，所以如果要铲除蛇灵总坛，必须先铲出蛇穴。
因此，狄仁杰带李元芳回来之后，便命令李元芳暗中查探蛇灵总坛。就这样经过两三个月的时间，李元芳慢慢的将蛇灵总坛的一切信息查清楚。而狄仁杰则是立即向皇帝请旨增派大军围剿蛇灵总坛。
一个月之后，蛇灵总坛被破，首领肖清芳被杀，并找出来假扮朝廷重臣的一干人等。可最后统计人数发现被清剿的人不到1000。果然，皇帝身边的蛇灵，将消息传了出去。
这次不过是替蛇灵清除了肖清芳一派的人手，蛇灵核心仍然在逃。
逃走的蛇灵依旧不肯安心，两个月后，寒山寺全寺僧众被屠杀殆尽。袁天罡终于逃出了生天。
此事惊动了皇帝武则天，她担心袁天罡所造成巨大的破坏。经过再三的思考，皇帝武则天只得将她与袁天罡的一切向狄仁杰和盘托出，令其侦破寒山寺僧众被屠一案，并在暗中查探袁天罡。
之后，狄仁杰根据张不凡所说的一些情报，暗中派遣人手监控太子府和太子卫率。果然，不久之后便发现太子卫率的人马，逐渐被换成蛇灵人手，在这之中，为此事做出重大贡献的千牛卫将军桓斌露出了他的狐狸尾巴。
待蛇灵将一切准备就绪之后，狄仁杰也安排好了一切。之后立刻上旨皇帝陛下，告知皇帝蛇灵已全部现身，只待皇帝出兵清剿出。皇帝武则天大喜，即刻下旨令狄仁杰携大将军王孝杰领兵出手办理此事，并着其便宜行事之权。